A PICkit2 kezelése nem igényel különösebb magyarázatot. A 9 V-os külső tápellátást most hagyjuk ki, az áramkörünket a PICkit2 is el tudja látni tápfeszültséggel (a számítógép USB kimenetéről...). Csatlakoztassuk a PICkit2 programozót az áramkörünkhöz. Az 1-es lábat kis háromszög jelzi a 2. oldalon bemutatott kapcsolási rajzon és a PICkit2 házán is, így könnyű elkerülni, hogy fordítva dugjuk rá a tüskesorra. Csatlakoztassuk a PICkit2-t a számítógép USB portjára is. Az MPLAB program Programmer menüjében válasszuk a PICkit2-t, majd visszafojtott lélegzettel figyeljük, hogy sikerül-e a mikrovezérlő felismerése... Szerencsés esetben egy ehhez hasonló üzenet jelenik meg a képernyőn:

 Initializing PICkit2 version 0.0.3.51
 Found PICkit2 - Operating System Version 2.32.0
 Target Power not detected - Powering from PICkit2 (3.25V)
 PIC24HJ128GP502 found (Rev 0x3002)
 PICkit2 Ready

A PICkit2 kész a programozásra. Csupán a Programmer menü "Program" pontjára kell kattintani. A programtároló memória törlése, a program beégetése és ellenőrzése után a "PICkit2 Ready" üzenet jelzi, ha befejeződött a kért művelet.

A program futtatásához már csak az kell, hogy a PICkit2 ne tartsa tovább RESET állapotban a mikrovezérlőt. Ehhez az MPLAB Programmer menüjében a "Release from Reset" (Reset elengedése) pontra kattintsunk. Ha az eddig folyamatosan világító LED1 elkezd barátságosan pislogni, akkor minden rendben, működik a program.

Figyelem! Ha a program futásakor a LED fényesebben világít, mint az előbbi, folyamatos módban, akkor elírtunk valamit a forráskódban vagy kifelejtettük a nyitott nyelőelektródás üzemmódba való kapcsolást (ODCB=0x8000). Sürgősen javítsuk ki a programot, mert így túlterheljük a mikrovezérlő kimenetét!